Donde actualmente se levanta la Escuela Nº 1, estuvo la primera iglesia de General Arenales, la cual se derrumbó por un ciclón que afectó a la zona en el año1889. Sin embargo, los vecinos decidieron levantar otra.
En 1903 se solicitó la aprobación de la Comisión Pro-Templo, siendo Cura Vicario de Junín, el Presbítero Mariano Alconchel y Obispo de La Plata, Monseñor Juan Terrero -cabe aclarar que General Arenales se atendía desde Junín y pertenecía al Obispado de La Plata-.
En el año 1904, el señor Vicente Locayamo donó el terreno para el templo. El 7 de junio de ese mismo año, se realizó la bendición de la piedra fundamental y se dio comienzo a los trabajos, los cuales insumieron un costo de 6 mil pesos moneda nacional, de los cuales 2 mil fueron donados por la señora María Unzué de Alvear, y el resto fue recaudado mediante la realización de algunas colectas y festejos populares.
El 18 de diciembre de 1905, el Obispo de La Plata, Monseñor Juan Terrero, firmó el decreto de erección de una Capellanía Vicaria, bajo el patrocinio de Nuestra Señora del Pilar, y se nombró Capellán Vicario al Presbítero Vicente Auffray, quien ejerció su ministerio durante un año.
Durante el año 1920 cambió de denominación, y pasó a llamarse Parroquia Nuestra Señora de La Merced.
Años más tarde, fue elevada al rango de Parroquia; perteneciendo desde el año 1938 a la Diócesis de Mercedes, y actualmente a la de San Nicolás.
A instancias del presbítero Francisco Platanía -quien ejerció su ministerio en General Arenales desde 1940 hasta el año 1956-, se iniciaron en 1941 los trámites para la demolición y reconstrucción de la iglesia, que se concretó durante su dirección.
El 7 de septiembre de 1986, se ordenó el diácono Juan Enrique Antón, primer sacerdote que recibe este título en General Arenales.
En la actualidad, se encuentra al frente de esta Parroquia el Presbítero Emilio Becerra.